会員（直接組合） | 間接会員 | 支部 |
| 北海道内航海運組合 | ||
| 東北内航海運組合 | ||
| 新潟内航海運組合 | ||
| 関東沿海海運組合 | ||
| 千葉県内航海運組合 | ||
| 横浜地方海運組合 | ||
| 静岡県内航海運組合 | ||
| 中部沿海海運組合 | ||
| 東海内航海運組合 | ||
| 富山石川内航海運組合 | ||
| 大阪海運組合 | ||
| 日本沿岸曳船海運組合 | ||
| 兵庫海運組合 | ||
| 和歌山県海運組合 | ||
四国地方海運組合連合会 |
||
中国地方海運組合連合会 |
||
九州地方海運組合連合会 |
||
| 沖縄地方内航海運組合 | ||
会員（直接組合） １８ | 間接組合 ２７ | 支部 １４ |
合計 ５９ |
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会員（直接組合） | 間接会員 | 支部 |
| 北海道内航海運組合 | ||
| 東北内航海運組合 | ||
| 新潟内航海運組合 | ||
| 関東沿海海運組合 | ||
| 千葉県内航海運組合 | ||
| 横浜地方海運組合 | ||
| 静岡県内航海運組合 | ||
| 中部沿海海運組合 | ||
| 東海内航海運組合 | ||
| 富山石川内航海運組合 | ||
| 大阪海運組合 | ||
| 日本沿岸曳船海運組合 | ||
| 兵庫海運組合 | ||
| 和歌山県海運組合 | ||
四国地方海運組合連合会 |
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中国地方海運組合連合会 |
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九州地方海運組合連合会 |
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| 沖縄地方内航海運組合 | ||
会員（直接組合） １８ | 間接組合 ２７ | 支部 １４ |
合計 ５９ |
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